Dalam beberapa literatur, Koi digolongkan menjadi beberapa kelas/golongan berdasarkan karakteristik corak warnanya. Beragamnya warna ini dipengaruhi oleh sel warna yang terdapat di lapisan endodermis. Lapisan endodermis ini berisi dengan serat-serat yang berisi sel, pangkal sisik, urat-urat darah, dan sel darah. Dari karakteristik warna pada lapisan endoderis inilah Koi diklasifikasikan menjadi 15 kelompok.
- Kohaku
- Taisho Sanshoku
- Showa Sanshoku
- Beko
- Utsuri Mono
- Asagi
- Shusui
- Koromo
- Kawari Mono
- Goshiki
- Hikari Mojimono
- Hikari Moyomono
- Hikari Utsurimono
- Kin Gin Rin
- Tancho
3 Kelompoh paling atas merupakan kelompok yang paling digemari para Koi Keeper dan dijuluki dengan sebutan Gosanke (gosanke dalam bahasa Jepang bermakna tiga besar atau bisa juga diartikan keluarga inti).
